September 12, 2009: Berja - Alto de Sierra Nevada (175 km):
1 David Moncoutié (Fra) Cofidis       05:09:22  
2 Ezequiel Mosquera (Spa) Xacobeo Galicia 0:00:52  
3 Alejandro Valverde (Spa) Caisse d'Epargne 0:01:16  
4 Robert Gesink (Ned) Rabobank    
5 Ivan Basso (Ita) Liquigas    
6 Samuel Sánchez (Spa) Euskaltel-Euskadi 0:01:37  
7 Joaquím Rodríguez (Spa) Caisse d'Epargne 0:02:09  
8 Cadel Evans (Aus) Silence-Lotto 0:02:24  
9 Paolo Tiralongo (Ita) Lampre-NGC 0:02:31  
10 Amaël Moinard (Fra) Cofidis 0:03:37

Overall rankings after stage 12:
1 Alejandro Valverde (Spa) Caisse d'Epargne       56:23:08  
2 Robert Gesink (Ned) Rabobank 0:00:27  
3 Ivan Basso (Ita) Liquigas 0:01:02  
4 Cadel Evans (Aus) Silence-Lotto 0:01:23  
5 Samuel Sánchez (Spa) Euskaltel-Euskadi 0:01:32  
6 Ezequiel Mosquera (Spa) Xacobeo Galicia 0:01:46  
7 Joaquím Rodríguez (Spa) Caisse d'Epargne 0:05:02  
8 Paolo Tiralongo (Ita) Lampre-NGC 0:05:33  
9 Daniel Navarro (Spa) Astana 0:08:21  
10 Johnny Hoogerland (Ned) Vacansoleil 0:10:23